Ngôi Trường Bí Ẩn, hay còn được gọi là Trường Học Nội Trú, hứa hẹn mang đến một không gian xem đầy bí ẩn và rùng rợn. Phim xoay quanh một ngôi trường nội trú xa xôi, ẩn mình giữa khu rừng rậm, nơi ba năm một lần, thầy trò chọn ra những học sinh mới theo tiêu chí riêng. Mỗi thế hệ chỉ bao gồm chưa đến mười ba học sinh, sẽ trải qua ba năm ròng rã học tập tại đây.

Ngôi Trường Bí Ẩn đảm bảo những tiện nghi sang trọng và học sâu, thu hút những học sinh ưu tú, giàu có. Nhưng không phải điều đó biểu thị tất cả. Dường như, ngôi trường này xứng đáng hơn với tù ngục hơn là một trường học theo cách xây dựng cũng như những quy tắc khắt khe, cộng thêm với sự cô lập hoàn toàn. Sự đối lập giữa môi trường sang trọng và quy tắc hà khắc hứa hẹn sẽ là ngòi nổ cho những bất ngờ, mâu thuẫn và rùng rợn trong câu chuyện. Liệu những học sinh này có thể vượt qua những bí mật và thủ đoạn âm u bên trong Ngôi Trường Bí Ẩn hay sẽ trở thành nạn nhân của nó?